【摘要】【目的】对四川省主要小麦产区的小麦黄斑叶枯病致病菌进行分离与鉴定，分析其致病基因组成情况，探究其致病菌的致病力，明确其生理小种类型，为小麦黄斑叶枯病的防治提供理论基础。【方法】于2021—2022年在四川主要小麦产区采集小麦叶枯病样本，经病原菌分离，通过形态学观察分析，内部转录间隔区（ITS，internal transcribed spacer）序列分析，致病基因（Ptr ToxA 、ToxB 和 ToxC）扩增和小麦黄斑叶枯病鉴定系致病性测定相结合的方法对病原菌进行鉴定。【结果】在小麦叶枯病样本中共分离并鉴定出3个小麦黄斑叶枯病病原菌菌株，均为Pyrenophora tritici-repentis，其在所有分离得到的小麦叶枯病病原菌中所占比例较小。对3个小麦黄斑叶枯病病原菌菌落和分生孢子进行形态学观察，未发现显著差异，符合病原菌形态学鉴定标准。进一步对3个小麦黄斑叶枯病病原菌进行ITS序列分析，结果显示3个菌株与参考基因组（ID：AM887509）的ITS序列相似性达到100%。对致病基因Ptr ToxA、ToxB、ToxC进行扩增，3个菌株在ToxA和ToxB基因的位点上均未扩增出任何片段，但在ToxC基因位点上均成功扩增出约500 bp的条带。病原菌致病性鉴定结果显示，本研究分离得到的菌株在Prosper和6B365品种上表现出较强的致病性，引起大面积叶片黄化，而在Glenlea和6B662品种上则未出现明显的叶片坏死或黄化症状。在四川省主要小麦产区收集到的小麦黄斑叶枯病致病菌为Pyrenophora tritici-repentis生理小种3。【结论】本研究系国内首次针对Pyrenophora tritici-repentis不同生理小种进行鉴定报道，将为我国在小麦黄斑叶枯病的防治上提供重要参考。