【摘要】数字时代背景下，“数据密集型科学”成为驱动前沿科技创新的关键力量，对本土企业开展“基于科学的创新”提出了新的能力要求。本研究以37个本土企业为研究样本，采用扎根分析和定性比较分析(QCA)结合的多案例研究方法，探索本土企业在数字时代开展“基于科学的创新”的能力体系结构，以及构建能力体系的差异化路径。研究发现：(1)数据密集型科学能力、数据工程能力、科学与社会的交互能力构成了数字时代本土企业开展“基于科学的创新”的能力体系；丰富的数据资源、良好的数据基础设施、先进的数据底层技术为能力体系构建提供了资源条件。(2)本土企业在数字时代构建“基于科学的创新能力体系”根据自身特点遵循不同路径：科学型企业一般依循“科学—工程—社会”为序次的数据密集型科学驱动路径；互联网平台型企业多采用“工程—科学—社会”为序次的数据工程推动路径；研产销一体化企业常遵循“社会—科学—工程”为序次的社会应用拉动路径。研究反映出数字时代基于科学的创新领域中科学、技术、工程、应用间的交互关系，为本土企业获取“数据密集型科学研究范式”带来的创新机会，在前沿科技领域实现创新提供理论参考和管理启示。