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基于COⅠ基因构建西北太平洋常见鱼类DNA条形码参考数据库

2024-07-15分类号:S931.1

【作者】徐颖琪   梁绪虹   陈新军   宋成辉   彭祖焜   王丛丛
【部门】上海海洋大学海洋生物资源与管理学院  大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室  国家远洋渔业工程技术研究中心  农业农村部大洋渔业可持续利用重点实验室  临港新片区海洋生物医药科技创新型平台  
【摘要】西北太平洋以其独特的地理位置和复杂的海洋环境,孕育了极为丰富的渔业资源,成为全球海洋生物多样性保护和渔业资源管理的热点区域。为了更有效地进行鱼类种类识别和多样性的调查,本研究建立了西北太平洋常见鱼类DNA条形码本地数据库。基于线粒体COⅠ基因,对2023年6—8月在西北太平洋海域所采集的307份样品进行扩增和测序,共获得7目13科20属25种鱼类的COⅠ基因序列。77.96%的COⅠ序列在公共数据库中都能比对到高相似度序列。种间平均遗传距离为0.233,种内平均遗传距离为0.003,种间遗传距离是种内遗传距离的77.67倍,且能够形成明显的条形码间隙,不存在物种区分困难的现象。基于COⅠ基因序列构建的系统发育树显示,同一属的鱼类首先聚为一支,随后与同一科的鱼类聚为一支,最后,同目不同科的鱼类聚为一支。综上所述,COⅠ基因具有物种特异性,能够有效地区分西北太平洋常见鱼类物种,本数据库的初步建立,有利于后期利用环境DNA技术进行西北太平洋鱼类多样性的监测和调查,为西北太平洋海域生物多样性保护、资源管理和种群动态监测提供了技术支持。
【关键词】鱼类  COⅠ基因  DNA条形码数据库  西北太平洋
【基金】农业农村部全球渔业资源调查监测评估(公海渔业资源综合科学调查)专项(D-8025-23-1002);; 上海市高校特聘教授“东方学者”岗位跟踪计(GZ2022011)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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