【摘要】长江流域是我国重要的生态屏障，近几十年来，剧烈的气候变化和人类活动改变了长江流域的自然景观，并使其生态系统结构发生改变，生态系统功能退化。本研究采用活力-组织-弹性-生态系统服务功能评价框架，在县域尺度上计算了2000-2020年长江流域生态系统健康指数（Ecosystem Health Index， EHI），利用空间自相关方法分析了生态系统健康的空间聚集效应，并基于最优参数地理探测器模型和地理加权回归模型揭示了驱动因素的独立效应和联合效应及驱动因素的空间变化特征。结果表明：（1）长江流域生态系统健康水平整体较好，EHI均值为0.545，中下游高于上游，南部高于北部，生态系统水平较高的地区主要分布在林地及其周围，二十年间，长江流域的生态系统健康水平呈现改善趋势；（2）研究期内，长江流域生态系统健康水平呈现显著的空间集聚效应，且空间集聚程度呈现减弱趋势；（3）在驱动因子方面，影响长江流域生态系统健康的主导因素是土地利用强度和林地占比，自然因素对流域大部分区域有正向影响，社会经济因素对流域大部分地区有负向影响，且社会经济因素对长江流域生态系统健康的影响力度要大于自然因素。本研究可为长江流域生态系统的保护和管理，促进长江流域可持续协调发展提供理论参考。