【摘要】eDNA监测技术有助于提高水生生物种类组成监测和种群健康监测的效率，而eDNA监测的空间分辨率未量化阻碍了常态化系统化eDNA监测的实施。为了量化eDNA监测的空间分辨率，探索建立了一个基于流域生物信息流分析框架和eDNA监测空间分辨率概率化表述的量化方法，并在长江中游开展了案例研究。2020年6月(平水期)在长江中游设置30个采样断面，断面间隔在30 km左右，开展eDNA采样，进行高通量测序(原核生物用16S rRNA基因扩增子测序、真核生物用线粒体COI基因扩增子测序),根据流域生物信息流分析框架计算eDNA所能监测到的生物信息输移的量化特征，确定eDNA监测空间分辨率(系列)值及其可信度、覆盖度。结果显示长江中游平水期，eDNA监测原核生物达到90%以上覆盖度对应的空间分辨率为27 km(可信度为84.18%),监测真核生物达到90%以上覆盖度对应的空间分辨率为6 km(可信度为41.38%),达到80%以上覆盖度对应的空间分辨率为13 km(可信度为50.64%);监测原核生物达到90%以上可信度对应的空间分辨率为58 km(覆盖度为82.30%),监测真核生物达到90%以上可信度对应的空间分辨率为78 km(覆盖度为38.61%),达到80%以上可信度对应的空间分辨率为50 km(覆盖度为49.70%)。研究结果可为其它eDNA监测空间分辨率估算工作提供方法借鉴，为长江中游eDNA监测断面设置提供量化参考。