【摘要】由于编制口径、编制时间、编制周期以及编制依据等方面的差异，政府会计制度下高校的内部预算与外部预算并没有实现有效协同，预算对高校财务发展的推动作用受到制约。本文就政府会计制度下高校内部预算与外部预算的关系进行重新梳理，明确其协同方面问题，并针对两本预算有效协同的实现提出针对性、多元化的对策和建议，以期为高校实务工作的开展提供参考。