【摘要】构建协同攻关的重大科技任务组织运行机制是体现国家战略目标、优化科技资源配置的重要方式，也是充分发挥社会主义市场经济条件下新型举国体制优势的重要途径。然而，目前学界对重大科技任务组织运行机制尚未形成一个基于动静结合视角的系统分析框架，且以科研部门为协同单元的跨部门协同的实证研究相对较少。为此，聚焦国家科研机构内部，以部门间横向关系为重点，选取中国科学院空天信息创新研究院和中国科学院理化技术研究所承担的重大科技任务为研究对象，基于“结构—程序—成果”分析框架，分别对其结构性协同机制、程序性协同机制和成果协同机制进行分析。研究发现：对于开展重大科技任务攻关，就特定领域的合作事项进行精细化分类并联合多元主体协同攻关是其横向协同组织模式的主要体现；其目标设置具有针对性、稳定性并有关键时间节点与要求，突出选题的引领性，其中选题有自上而下和自下而上两种方式；均是采取以技术资源储备为基础，在国家战略需求牵引下从理论走向工程的协同攻关模式；其评价体系以重大成果产出为导向，同时会根据过程节点和目标作出动态调整；此外，其科技成果稳定维持不能仅依靠相关研究团队或任务依托单位。据此，提出建立重大科技任务分解与落实机制，通过自上而下与自下而上相结合确定重大科技任务选题来源，建立关键技术、原始创新和工程一体的资源整合机制，建立差异化、多元化的灵活分类激励机制和强化跨领域跨学科合作机制的可持续性等建议。