基于mtDNA D-loop序列分析青海省果洛州牦牛遗传资源的母系遗传多样性及群体遗传结构
2024-06-05分类号：S823.85
【部门】青海大学畜牧兽医科学院/青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室/农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室 青海省果洛州班玛县畜牧兽医站 青海省牦牛繁育推广服务中心 青海省果洛州久治县索乎日麻乡畜牧兽医站 青海省果洛州玛多县花石峡镇措柔村拉泽生态畜牧业专业合作社 青海省畜禽遗传资源保护利用中心 青海省果洛州农牧和科技局
【摘要】为从分子水平上对青海省果洛藏族自治州牦牛遗传资源进行系统评估，分析其母系遗传多样性、群体遗传结构和群体遗传分化，本研究对甘德、班玛、久治和玛多牦牛群体共152头个体进行线粒体DNA(mtDNA)Dloop区测序，并从GenBank下载已公布的37条达日牦牛和32条玛沁牦牛的相应序列，对这6个牦牛群体mtDNA D-loop序列进行综合分析。结果表明：1)221条牦牛mtDNA D-loop序列（636～638 bp）比对分析共检测出57个变异位点，包括8个单一多态位点和49个简约信息位点。根据D-loop序列间核苷酸变异共确定了45种单倍型，其中班玛、达日、甘德、久治、玛多、玛沁牦牛群体分别拥有1、6、5、4、7、6种特有单倍型。2)6个牦牛群体总的单倍型多样度和核苷酸多样度为0.901和0.014，表明其母系遗传多样性丰富。其中，甘德牦牛的单倍型多样度最高（Hd=0.951），久治牦牛的单倍型多样度最低（Hd=0.818）。3）遗传分化和基因流分析表明，除久治牦牛与班玛、甘德、玛沁牦牛群体间分化程度均呈中等遗传分化水平（0.05≤FST<0.15），基因交流相对贫乏外，其他牦牛群体间FST值较小（0
【关键词】牦牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性 遗传分化 群体结构 系统发育
【基金】青海省“昆仑英才·高端创新创业人才”计划（领军人才）项目和畜禽遗传资源普查项目
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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