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球茎甘蓝MYB62转录因子的克隆与表达特征分析

2024-04-28分类号:S635.2

【作者】王鑫淼   赵孟良   邵登魁   尕桑   任延靖
【部门】青海大学青海省蔬菜遗传与生理重点实验室  青海大学省部共建三江源生态和高原农牧业国家重点实验室  玉树藏族自治州农牧业综合服务中心  
【摘要】为了明晰球茎甘蓝MYB62转录因子的序列特征及其在逆境胁迫后的表达特征,进一步探索球茎甘蓝MYB62转录因子的生物学功能,为后续MYB62转录因子功能鉴定提供理论依据,以球茎甘蓝为研究对象,采用同源克隆的方法获得球茎甘蓝MYB62转录因子基因,并对其进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR的方法分析MYB62在球茎甘蓝不同组织间以及逆境胁迫后的表达特征。基因克隆结果表明,BocMYB62基因gDNA全长1 353 bp, CDS为837 bp,包括4个外显子和3个内含子,编码278个氨基酸。序列结构分析结果显示,BocMYB62为亲水性蛋白,具有2个SANT-MYB结构域,属于R2R3-MYB型MYB转录因子;空间结构预测显示其具有典型的α-螺旋结构;系统发育分析表明,BocMYB62与甘蓝型油菜MYB62亲缘关系最近。时空表达结果显示,BocMYB62在绿色球茎甘蓝中的表达量始终高于在紫色球茎甘蓝中,且存在明显的组织特异性,在干旱胁迫后BocMYB62表达量显著升高,胁迫12 h表达量最高,低温胁迫后BocMYB62表达量显著低于对照,在4℃低温胁迫时表达量最低,推断BocMYB62可能参与花青素生物合成调控,并可能参与逆境胁迫的调控作用。
【关键词】球茎甘蓝  MYB62  序列分析  保守基序  亲缘关系  荧光定量PCR
【基金】国家大宗蔬菜产业技术体系项目(CARS-23-G26);; 科技成果转化专项(2023-NK-144);; 青海省“高端创新人才千人计划”项目(K9923197)
【所属期刊栏目】华北农学报
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