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半滑舌鳎突触体相关蛋白29基因(SNAP29)克隆及其组织分布和时序表达分析

2024-04-28分类号:S917.4

【作者】吴茵茵   温思怡   韩卓然   孙敬锋
【部门】天津农学院  农业农村部智慧养殖重点实验室(部省共建)  天津市水产生态及养殖重点实验室  天津农学院水产学院  
【摘要】为了分析半滑舌鳎突触体相关蛋白29基因(SNAP29)的分子生物学特征、组织分布特点以及感染海藻希瓦氏菌后的时序表达规律,通过RT-PCR、生物信息学网站、qRT-PCR技术对半滑舌鳎SNAP29基因进行了扩增、生信分析和表达特征研究。结果表明,半滑舌鳎SNAP29基因CDS区长度为789 bp,编码262个氨基酸,理论等电点(pI)为5.39,分子质量为29.717 81 ku,有2个典型的SNARE结构域;二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲组成,二级结构和三级结构基本一致;多序列比对结果显示,半滑舌鳎与欧洲鲈鱼SNAP29基因相似性最高;SNAP29基因在健康半滑舌鳎所测的各组织中均有表达,在鳃组织中表达最高,在脑组织中表达量最低;利用海藻希瓦氏菌人工感染半滑舌鳎后,SNAP29基因在肠道组织、心脏组织和脑组织中表达量主要呈现上调趋势,在肝脏、头肾、脾脏组织中主要呈现下调表达,SNAP29基因在健康半滑舌鳎组织中均有表达;海藻希瓦氏菌感染半滑舌鳎的肠道、脑、心脏、肝脏、头肾、脾脏组织中SNAP29基因呈现差异表达。综上,SNAP29可能参与机体免疫应答过程或病理生理过程。
【关键词】半滑舌鳎  SNAP29  基因克隆  qRT-PCR  海藻希瓦氏菌
【基金】国家自然科学基金项目(31972840);; 天津市海水养殖产业技术体系项目(ITTMRS2021007);; 农业农村部智慧养殖重点实验室(部省共建)开放基金项目(2023-TJAULSBF-2105)
【所属期刊栏目】华北农学报
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