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东方蜜蜂微孢子虫RRDRP的分子特性及系统进化分析

2024-05-11分类号:S895.236

【作者】张凯遥   冯佩林   宓诗雨   郭思佳   张艺琼   荆欣   陈大福   郭睿   付中民
【部门】福建农林大学蜂学与生物医药学院  福建农林大学天然生物毒素国家地方联合工程实验室  福建省蜂疗研究所  
【摘要】【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Rad18-like重组与DNA修复蛋白(Rad18-like recombination and DNA repair protein, RRDRP)进行系统进化分析,为进一步研究其功能提供理论依据。【方法】利用Protparam、ProtScale和SWISS-model等软件分析RRDRP的理化性质、亲水性和三级结构。利用SignalP 4.1 Server、NetPhos 3.1 Server、TMHMM和SOPMA等软件预测RRDRP的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域及二级结构。使用PSORTⅡ软件预测RRDRP蛋白的亚细胞定位。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种RRDRP的保守基序。通过Mega 11.0软件对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RRDRP进行氨基酸序列多重比对,并采用邻接法构建系统进化树。【结果】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP基因含有2 928个核苷酸,可编码975个氨基酸,分子质量约11.50 ku,脂溶系数93.58,等电点6.63,分子式C_(5135)H_(8253)N_(1377)O_(1545)S_(34),平均亲水系数为-0.627,可同时定位于细胞核、细胞质、过氧化物酶体和细胞骨架;RRDRP包含55个磷酸化位点、678个α-螺旋、99条延长链、22个β-转角及176个无规则卷曲;RRDRP不含信号肽与跨膜结构域。东方蜜蜂微孢子虫、兔脑炎微孢子虫、颗粒病微粒子虫等11个物种的RRDRP中均含有5个相同的保守基序(Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4和Motif 5)。东方蜜蜂微孢子虫与颗粒病微粒子虫在进化树上聚为一支,同源性较高。【结论】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP是潜在的亲水性蛋白和胞内蛋白,在东方蜜蜂微孢子虫以及其他微孢子虫和真菌中高度保守。
【关键词】东方蜜蜂微孢子虫  染色体结构维持蛋白  Rad18-like重组和DNA修复蛋白  分子特性  系统进化
【基金】国家自然科学基金项目(32172792);; 国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-44-KXJ7);; 福建省自然科学基金项目(2022J01131334、2023J01133656);; 福建农林大学硕士生导师团队项目(郭睿);; 福建省大学生创新创业训练计划项目(202310389027、X202310389084)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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