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木薯MeTGA9.3转录因子鉴定及其下游调控基因预测

2024-05-16分类号:S533

【作者】张宏图   熊华   江李伟   张圆雷   于晓玲   曾长英   阮孟斌
【部门】海南大学热带农林学院  中国热带农业科学院热带生物技术研究所  中国热带农业科学院三亚研究院  
【摘要】[目的]鉴定木薯TGA转录因子MeTGA9.3调控的靶基因,为进一步研究该转录因子在调控木薯水分和氮营养协同高效利用方面的功能奠定基础。[方法]基于亚细胞定位和转录自激活实验确定MeTGA9.3的转录因子特性;利用DAP-Seq技术在全基因组水平上分析MeTGA9.3转录因子识别并结合的DNA元件和下游基因。[结果]木薯MeTGA9.3蛋白定位于细胞核中,且该蛋白在酵母中具有明显的转录自激活活性。MeTGA9.3启动子可驱动GUS报告基因在转基因拟南芥根部显著表达。MeTGA9.3转录因子识别并结合的优势DNA元件为TGACGTCA,在预测的下游靶基因中发现与逆境胁迫相关的LEA、ERF、MYC等家族成员,同时还包括3 个氮转运蛋白NRT1家族成员。[结论]本研究鉴定了木薯MeTGA9.3的转录因子特性,发现MeTGA9.3可能具有协同调控干旱胁迫响应和氮素转运的潜在功能,为进一步揭示木薯水分和氮素高效利用的分子机制奠定基础。
【关键词】木薯  TGA  转录因子  DAP-Seq  干旱胁迫  氮素转运蛋白
【基金】国家自然科学基金项目(32272037);; 中国热带农业科学院中央公益性科研单位基础研究基金(1630052022008);; 海南省自然科学基金面上项目(322MS146)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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