【摘要】【目的】探明云南水稻纹枯病菌AG-Bb融合亚群的病毒种类，筛选可有效降低水稻纹枯病菌致病力的真菌病毒，为防治水稻纹枯病提供生防病毒资源。【方法】使用二代测序技术（NGS），鉴定水稻纹枯病菌AG-Bb融合亚群菌株8-Q-36、2-R-11和2-Q-13的病毒种类，利用利巴韦林-高温尖端脱毒法筛选具有降低寄主致病力的病毒。【结果】通过比对分析菌株8-Q-36、2-R-11和2-Q-13序列，发现所获得的病毒可归类于6个真菌病毒科：双分体病毒科（Partitiviridae）、内源体病毒科（Endornaviridae）、镰刀菌病毒科（Fusariviridae）、线粒体病毒科（Mitoviridae）、横纹病毒科（Rhabdoviridae）、全病毒科（Totiviridae），以及部分未分类病毒。与原始菌株8-Q-36相比，脱毒菌株8-Q-36-1的菌落形态更为蓬松，菌核有明显的色素沉着，且致病力明显增强。经双链RNA（dsRNA）提取检测发现，脱毒菌株8-Q-36-1中最大的一条≥10 kb的dsRNA缺失，由此可判定该dsRNA能够降低寄主致病力。经NCBI比对，发现该dsRNA的部分序列为RdRp序列，且与内源体病毒科的RdRp序列具有同源性，与相似性最高的病毒RsEV6序列的一致性为56.02%，因此菌株8-Q-36的分离物可能是一种新病毒，暂命名为RsEV11。【结论】水稻纹枯病菌AG-Bb融合亚群菌株8-Q-36、2-R-11和2-Q-13具有丰富的病毒多样性，其中菌株8-Q-36中存在能够降低水稻纹枯病菌致病力的生防病毒分离物。本研究首次在双核丝核菌属（Ceratobasidium spp.）中发现了具有生防价值的真菌病毒。