【摘要】【目的】筛选适合云南省植烟水稻土耕层土壤质量提升及烟叶提质增效、烤烟与多元产业有效融合的最佳种植模式。【方法】以烤烟品种云烟87号为材料，在水稻土上进行3年大田试验，设置5个处理：烤烟连作（T1，CK）、2年紫花苜蓿—1年烤烟轮作（T2）、1年紫花苜蓿—2年烤烟轮作（T3）、烤烟套作玉米（T4）、烤烟—羊肚菌轮作（T5），探讨种植模式对烟田土壤理化特性、土壤微生物数量和烟叶产量、品质的改良效应。【结果】与T1（CK）相比，烤烟轮作、套作后土壤容重降低2.47%～21.77%，土壤孔隙度、阳离子交换量及有机质、水解性氮、有效磷、速效钾含量显著增加，土壤水溶性氯无明显变化；且能提高土壤中大粒径团聚体含量，改善土壤结构及其稳定性。与T1（CK）相比，烤烟轮作、套作后根际土壤的真菌、细菌、放线菌数量均显著增加，增幅分别为61.82%～176.4%、13.0%～49.73%、25.38%～130.05%，微生物量碳、氮及碳氮比分别提高13.81%～60.38%、9.96%～52.40%、3.51%～5.48%。烤烟轮作、套作后烟叶的叶面积、上等烟比例、产量和产值显著增加，其中处理T2、T5产值最高，分别较T1（CK）显著提高43.28%、50.22%。与T1（CK）相比，T2、T3、T4、T5烟叶总糖、还原糖、钾含量显著升高，增幅为13.96%～56.51%、7.46%～27.91%、40.76%～52.72%；烟叶总氮、烟碱含量则显著降低4.13%～11.00%、3.39%～16.41%。【结论】采用“烤烟—紫花苜蓿”“烤烟—羊肚菌”轮作体系，可提升土壤肥力，改善土壤通透性、团聚体结构及土壤微生物群落丰度；对提高烟叶产量、产值，改善烟叶化学成分协调性作用效果明显。