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七彩神仙鱼β-胸腺素基因克隆及表达分析

2024-05-15分类号:S965.8

【作者】彭啸   温彬   陈再忠   高建忠
【部门】上海海洋大学  农业农村部淡水水产种质资源重点实验室  上海海洋大学  水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室  上海海洋大学  水产科学国家级实验教学示范中心  
【摘要】为了探究胸腺素基因在七彩神仙鱼(Symphysodon aquifasciatus)中的特征、进化和功能,基于转录组序列比对及生物信息学的方法对七彩神仙鱼的胸腺素进行了鉴定、基因与蛋白结构分析、系统发生分析,通过RACE技术克隆获得了七彩神仙鱼胸腺素基因全长,利用qRT-PCR技术研究其在各组织中的表达规律,通过病原感染实验,研究了七彩神仙鱼β-胸腺素基因在病原胁迫下的表达规律。结果显示,七彩神仙鱼的胸腺素基因鉴定为胸腺素β1型,命名为dfTβ。克隆结果显示,dfTβ的全长为779 bp, ORF区序列长度为303 bp,编码100个氨基酸,其5′-UTR为43 bp, 3′-UTR为433 bp,含有22个poly-A。系统发育进化分析结果显示,七彩神仙鱼β-胸腺素同尼加拉瓜湖始丽鱼β-胸腺素聚为一簇。qPCR结果显示,β-胸腺素在七彩神仙鱼各组织中均有表达,其中在肠、皮肤、鳃中表达最高,在头肾和脾中表达最低。嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染后,七彩神仙鱼皮肤、头肾、脾和肠中dfTβ均在短时间内显著上调,并随着时间出现先上升后下降的趋势,但各组织中上调倍数最高峰的时间不同。研究结果表明,dfTβ基因参与了七彩神仙鱼受病原刺激后的免疫应答,且表达模式不同,表明其可能在不同组织、免疫的不同阶段发挥不同的作用。
【关键词】七彩神仙鱼(Symphysodon aquifasciatus)  β-胸腺素  基因克隆  表达分析
【基金】上海市自然科学基金(20ZR1423600)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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