【摘要】为探究新型研发机构组织性嵌入的内在机制，从关系合同理论视角出发，构建由关系嵌入结构﹑合同治理结构组成的关系合同结构分析模型，分析新型研发机构嵌入性组织悖论的理论内涵和典型特征，并基于“主体-过程”二元视角进行理论阐释。研究认为，新型研发机构作为一种嵌入性组织具有投资主体多元化的特征，其本质上是一种以直接联结和间接互动为纽带的多元交易关系，是一种多主体协同互动的关系合同；其组织性嵌入分为正向嵌入和反向嵌入，表现形式为产权关系﹑结构互嵌和制度关系，演化过程表现为在初创期建设主体被动地实现正向嵌入﹑成长期排斥建设主体的组织性嵌入而成熟期与建设主体出现双向嵌入；其所面临的嵌入性组织悖论本质上是多主体协同合作与多头决策低效之间的悖论，悖论的破解既需要其与建设主体二者关系质量带来的协同优势，也需要二者关系位置带来的控制优势。