栀子WRKY基因家族鉴定及其响应盐胁迫的表达模式
2024-02-21分类号:S685.99
【部门】福建农林大学林学院 自然生物资源保育利用福建省高校工程研究中心 福建农林大学植物保护学院
【摘要】【目的】为进一步研究WRKY基因家族在调控栀子盐胁迫中的功能作用、培育栀子抗盐新品种。【方法】利用生物信息学方法对栀子WRKY基因家族成员(GjWRKY)进行全基因组鉴定和相关分析。【结果】共鉴定出47个WRKY基因,非均匀地分布在10条染色体上,通过系统发育树将其分为3大组:Group Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ。GjWRKY基因以串联重复为主要扩增方式,且多数基因成员含有3个外显子。GjWRKY基因家族启动子2000 bp区域含有大量激素类和胁迫类响应顺式作用元件。46个GjWRKY基因在中度(MS)和重度盐胁迫(SS)下具有不同程度的高表达,部分GjWRKY基因产生特异性表达,17个GjWRKY基因表现为上调表达,推测这部分GjWRKY基因可能起正调控作用。【结论】GjWRKY基因在栀子抗盐胁迫中发挥了重要作用。
【关键词】栀子 WRKY基因 盐胁迫 生物信息学 系统进化分析
【基金】福建省林业科技推广项目(2022TG09);; 福建省科技厅高校产学合作项目(2022N5009)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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