非生物胁迫下青花菜内参基因的筛选
2024-01-26分类号:S635.3
【部门】昆明学院农学与生命科学学院 温州科技职业学院农业与生物技术学院
【摘要】【目的】为检测非生物胁迫下常见内参基因的表达稳定性,筛选出青花菜的适内参基因。【方法】以青花菜高代自交系“KU19-3”为试验材料,利用已有的转录组数据和结合现有文献,筛选出31个候选内参基因,对其在不同非生物胁迫下(盐、干旱、渍水、弱光、高温和低温)的表达水平进行荧光定量PCR检测,采用geNorm、Normfinder 和BestKeeper软件分析其表达稳定性,从而筛选出适宜的内参基因。【结果】31个候选内参基因的扩增特异性良好,且表达水平差异明显。其中BOL029171的Ct值最小,表达量最大;而BOL001470的Ct值最大,表达量最小。其他基因的Ct值介于20~40。三种软件综合分析结果表明:BOL034565和BOL008820在高温胁迫下最稳定,BOL043724和BOL005937在弱光胁迫下表达稳定性最好,BOL043724和BOL001470、BOL005937和BOL006136分别在低温和盐胁迫下表达最稳定,BOL024326和BOL025875、BOL008820和BOL001788分别在渍水和干旱胁迫处理下表达最稳定。综合上述得出BOL006136和BOL008820可作为非生物胁迫下青花菜的通用内参基因。【结论】本研究筛选出青花菜叶片在非生物胁迫下通用内参基因是BOL006136和BOL008820,结果可为以后开展青花菜逆境胁迫下相关基因的表达特征研究和青花菜抗逆种质创建提供一定的科学基础。
【关键词】青花菜 内参基因 实时荧光定量PCR 非生物胁迫
【基金】云南省科技厅基础研究专项青年项目(2019-1-C-25318000002236);; 云南省地方本科高校(部分)基础研究联合专项(2018FH001-044,202301BA070001-21);; 浙江省自然科学基金项目(LY18C150006);; 浙江省十四五农业新品种选育重大科技专项(中晚熟青花菜新品种选育)(2021C02065-4-2);; 温州市科技项目(2019ZX007-2)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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