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彩色马铃薯响应UV-B辐射的转录组学分析

2024-03-23分类号:S532

【作者】董秋菊   吴晓杰   张晓龙   肖继坪
【部门】云南农业大学农学与生物技术学院  虎跳峡镇农业综合服务中心  
【摘要】【目的】探究彩色马铃薯对UV-B 辐射具有较强的耐受性的机理,通过转录组分析马铃薯对UV-B辐射响应的分子机制,为筛选马铃薯耐UV-B 辐射相关基因提供理论依据。【方法】以彩色马铃薯‘花心洋芋’为试验材料,对全生育期进行UV-B辐射处理,选取成熟期的块茎,采用Illumina HiseQ2500平台进行测序分析。【结果】共得到232285320个有效测序读长数,且与参考基因组比对率超过78.5%,GC含量均超过42.1%。通过分析筛选到843个差异表达基因(DEGs),包括544个上调基因和299个下调基因。GO功能分析表明,‘花心洋芋’的DEGs主要富集在代谢过程、细胞组分和催化活性。KEGG富集分析发现,‘花心洋芋’主要通过代谢途径中的碳水化合物代谢通路来响应UV-B辐射,转录因子主要是ARR-B、AP2-EREBP、MADS、bHLH和NAC等与响应光信号和环境胁迫相关的转录因子。【结论】‘花心洋芋’响应UV-B辐射的主要通路为代谢途径中的碳水化合物代谢通路,转录因子ARR-B、AP2-EREBP、MADS、bHLH和NAC均起到一定的调控作用。
【关键词】彩色马铃薯  UV-B辐射  转录组  差异表达  转录因子
【基金】国家自然科学基金项目(32060500);; 云南省基础研究计划-面上项目(202301AT070501);; 云南省农业基础研究联合专项-重点项目(202301BD070001-135);; 云南省“兴滇英才支持计划”青年人才项目(YNWR-QNBJ-2020-138)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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