【摘要】构建跨专业组织是高职院校回应社会现实问题重大关切，推进有组织科研的重要举措，有利于促进高职院校科研创新能力的提升。基于高职院校教师的结构化访谈和跨专业行为问卷调查发现，当前我国高职院校跨专业研究仍处在创建和发展阶段，面临的主要障碍是管理体制不合理等问题。跨专业组织管理与运行机制、跨专业活动文化氛围和产学政研合作关系等特征要素对科研创新能力具有显著的正向影响；高特征水平高职院校的科研创新能力显著高于低特征水平院校。据此，高职院校应精准定位组织目标，科学布局跨专业组织发展；加快组织结构变革，构建高效的跨专业组织运行机制；营造支持性组织环境，激发跨专业组织创新活力。