日本对虾热休克蛋白基因家族的鉴定及其在发育时期的表达
2023-12-21分类号:S917.4
【部门】上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心 海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 日照市海洋与渔业研究院 江苏海洋大学
【摘要】热休克蛋白(HSPs)是一类广泛存在于原核和真核生物细胞的亚细胞区室中具有高度保守性的蛋白质,具有参与蛋白质折叠、蛋白质修复和免疫等多种功能,在机体生长发育过程中发挥重要作用。为进一步研究日本对虾(Penaeus japonicus) hsp基因家族特征及在胚胎发育时期的表达特征,本研究通过生物信息学技术对日本对虾hsp进行鉴定,并对其结构域、基因结构、染色体定位、编码蛋白的理化性质和在胚胎不同发育时期的表达特征进行分析,鉴别出15个Pjhsp基因,包括1 个Pjhsp10、2个Pjhsp20、2个Pjhsp40、1个Pjhsp60、6个Pjhsp70和3个Pjhsp90,其中,7个蛋白的理化性质较稳定,不稳定系数小于40;亚细胞定位结果显示,7个PjHSP定位到细胞质,2个定位到细胞核,2个定位到细胞外基质,2个定位到内质网,2个定位到线粒体。Pjhsp基因家族中Pjhsp40-15.349、Pjhsp70-39.287和Pjhsp70-1.298等在胚胎时期大量表达;Pjhsp20、Pjhsp70-3.662、Pjhsp70-15.369、Pjhsp70-32.916和Pjhsp90-12.759等在幼体发育时期大量表达。本研究明确了日本对虾hsp家族的基因特征、系统进化关系及其在发育时期的表达规律,丰富了日本对虾hsp家族的基础信息,为进一步探讨该家族在日本对虾生长发育中的作用提供了参考。
【关键词】日本对虾 热休克蛋白 发育时期 表达规律
【基金】山东省农业良种工程项目(2023LZGC020);; 青岛西海岸新区科技项目(23-1-3-hygg-21-hy);; 中国水产科学研究院基本科研业务费(20603022022021; 20603022023003);中国水产科学研究院院级基本科研业务费(2023TD50)共同资助;; 国家虾蟹产业技术体系(CARS-48)
【所属期刊栏目】渔业科学进展
文献传递