【摘要】我国正处于由“科技大国”向“科技强国”转型的关键时期。财政为国家创新体系的运行提供了必要的资源供给和政策支持，是国家创新体系转型与演化的重要物质基础。基于演化范式构建创新市场选择的演化分析框架，刻画国家创新体系内发生创新“突变”时所面临的不同市场选择，以及政府借助不同的财政科技投入方式影响科技创新的“遗传与扩散”过程。国家创新体系转型需遵循创新市场演化的基本规律，顺应科技创新演化规律的财政科技支持手段方能促进国家创新体系成功转型。创新体系有效转型需从物质基础、市场选择、关键动力、融资机制四方面着力，为面向重大应用的基础研究提供稳定、持续增长的投入保障，以财政手段引导多元主体融合参与知识、技术和制度的共生演化过程，遵循不同科技创新活动的市场选择规律，最终提升我国国家创新体系的内循环动力。