标题
  • 标题
  • 作者
  • 关键词

水稻AP2/ERF转录因子家族及其相应miRNAs在叶片衰老中的表达

2024-03-18分类号:S511

【作者】蒋鑫   陈重先   刘梦兰   黄丹丹   李伟   缪颖   张玉
【部门】福建农林大学生命科学学院  福建省植物功能生物学与绿色农业重点实验室  
【摘要】【目的】探究水稻AP2/ERF转录因子在叶片衰老中的功能及其受miRNA和组蛋白修饰调控的转录机制。【方法】在全基因组水平对水稻(Oryza sativa)AP2/ERF家族成员及其上游靶向的miRNAs进行鉴定和生物信息学分析。对miRNA及其靶基因在水稻叶片衰老过程中的表达谱进行分析。通过RT-qPCR检测该家族成员及miRNAs在水稻叶片衰老过程中的互作关系。【结果】在水稻中共有155个AP2/ERF基因,所有成员启动子都含有光响应元件,大多数基因都具有茉莉酸(jasmonic acid, JA)、脱落酸(abscisic acid, ABA)和厌氧诱导顺式作用元件。预测到45个miRNAs靶向调控水稻AP2/ERF家族的58个成员。鉴定出一系列在水稻叶片衰老过程中呈显著负相关的miRNA-靶基因对,暗示这些miRNAs可能通过抑制AP2/ERF基因的表达,参与水稻叶片衰老过程的调控。同时,发现4个AP2/ERF基因的表达量及其组蛋白H3K9ac富集水平随水稻叶片的衰老持续上升,说明这些基因表达同时受到H3K9ac修饰调控。【结论】在水稻叶片衰老过程中AP2/ERF基因的转录受其相应靶向的miRNAs和组蛋白H3K9ac修饰的影响。
【关键词】水稻  AP2/ERF转录因子  叶片衰老  表观遗传修饰  miRNA调控  H3K9ac修饰
【基金】国家自然科学基金(32001437);; 福建省自然科学基金(2022J01597);福建省自然科学基金重点项目(2021J02025)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
文献传递