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基于线粒体COX1和ND1基因顺序的黄河上游大鼻吻■遗传多样性分析

2024-03-15分类号:S917.4

【作者】杨立强   刘彦斌   苟金明   王吉祥   刘凯   肖伟   王永杰   杨瑞兰   柳婷   刘哲   连总强
【部门】甘肃农业大学动物科学技术学院  宁夏回族自治区水产研究所  宁夏渔业工程技术研究中心  宁夏回族自治区水产技术推广站  喀什大学生命与地理科学学院  
【摘要】为探究黄河上游大鼻吻■(Rhinogobio nasutus)群体遗传多样性和遗传分化现状,本研究以永宁、平罗、磴口3个不同地理群体145尾大鼻吻■为研究对象,利用线粒体DNA COX1和ND1基因序列进行了遗传多样性分析。结果显示:COX1和ND1基因序列长度分别为1 466 bp、975 bp, A+T含量(57.25%,56.81%)均高于G+C(42.75%,43.19%)含量,具有明显的碱基组成偏向性;3个群体145尾样本中分别界定了11个和9个单倍型,均存在共享单倍型现象。在COX1和ND1基因序列中3个群体的平均单倍型多样性(H_d)、核苷酸多样性(π)及平均核苷酸差异(K)分别为0.745 3、0.001 3、1.841和0.364、0.000 48、0.472,3个群体遗传多样性呈现出磴口群体最高、平罗群体次之、永宁群体最小的特征。基于COX1和ND1的遗传变异分析(AMOVA),表明3个群体中遗传变异均主要来自群体内,且COX1基因序列中磴口群体与永宁群体之间存在显著性明显的遗传分化。基于线粒体COX1和ND1基因单倍型序列,采用邻近法(Neighbor Joining, NJ)构建系统进化树与单倍型网络结过具有一致性,表明3个群体之间无明显的谱系分化,结构比较单一,未发现形成单独分支的群体。中性检验结果显示,大鼻吻■进化历程符合中性进化假设,且可能存在群体扩张。因此,为了有效地保护大鼻吻■野生资源,建议将大鼻吻■从整体上进行就地保护。
【关键词】大鼻吻■(Rhinogobio nasutus)  黄河  COX1  ND1  遗传多样性
【基金】大鼻吻鮈种质资源保护遗传学及生殖发育和人工繁育技术研究(2023BCF01013);; 农业农村部财政专项“黄河渔业资源与环境调查”(HHDC-2022-02)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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