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牦牛FTL基因克隆、生物信息学及表达分析

2023-12-28分类号:S823.85

【作者】张娟香   马小勇   路建卫   仁青吉   罗胜伟   肖光峰   王有鹤   马晓明   喇永福   郭宪   褚敏   阎萍   梁春年
【部门】中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所  甘肃省牦牛繁育工程重点实验室  甘肃农业大学动物科学技术学院  农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室  合作市佐盖多玛乡畜牧站  合作市动物疫病预防控制中心  
【摘要】旨在了解牦牛铁蛋白轻链(FTL)基因的结构与功能,以及在不同年龄段8个组织中的表达规律。以成年(36月龄)美仁牦牛肝脏组织cDNA为模板,克隆FTL基因的编码区序列,并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量(qRT-PCR)技术检测FTL基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、脂肪、睾丸中的相对表达量。结果表明,美仁牦牛FTL基因的CDS区为528 bp,共编码175个氨基酸,与野牦牛和牛的亲缘关系最近(99.8%);FTL蛋白为稳定亲水性分泌蛋白,不存在信号肽和跨膜结构,主要分布在细胞质中,蛋白的二级结构以α-螺旋为主,主要与FTH1、SCARA5、NCOA4等蛋白存在相互作用。qRT-PCR结果显示,FTL基因在成年牛的表达量依次为肝脏、肾脏、睾丸,脾脏、肺脏、脂肪、背最长肌、心脏,在7日龄犊牛的脂肪和背最长肌组织中表达最高,成年牛中肝脏组织表达量最高;通过2个阶段比对发现,脂肪、背最长肌和心脏组织的表达量随美仁牦牛年龄的增长呈下降趋势,而肺脏、脾脏、睾丸、肾脏和肝脏组织的表达量随年龄的增长而升高。
【关键词】美仁牦牛  FTL基因  克隆  生物学分析  组织表达
【基金】甘肃省科技计划项目(20JR5RA580);; 甘肃省科技重大项目(21ZD10NA001;GZGG-2021-1);; 合作市牦牛种质提升与提质增效项目、现代农业(肉牛牦牛)产业技术体系建设专项资金(CARS-37);; 中国农业科学院科技创新工程(25-LZIHPS-01)
【所属期刊栏目】华北农学报
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