板栗WRKY基因家族鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析
2024-02-28分类号:S664.2
【部门】河北省农林科学院棉花研究所 沧州职业技术学院 河北省农林科学院昌黎果树研究所
【摘要】WRKY转录因子在植物生长和防御反应的调控中发挥着重要作用。为了探究WRKY基因家族在板栗抗旱中的功能,对板栗WRKY基因家族成员进行了鉴定,对其编码蛋白的理化性质、系统发育、结构等进行分析,并通过转录组测序和qRT-PCR技术分析其在干旱胁迫下的表达特征。通过生物信息学技术在板栗中共鉴定到65个WRKY基因家族成员,将其分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3组,其中Ⅱ组根据其结构和系统发育关系分为5个亚组。WRKY基因的结构和保守基序分析表明,外显子数目为1~7个,同一亚组的外显子数目和基序分布类似。WRKY基因保守结构域发生了一定的变异,包括WRKY七肽结构域的缺失,锌指结构的缺失,七肽结构域变异为WRKYGKK、WRKYGRK和WRKYGRK等。转录组测序数据表明,有4个WRKY基因家族成员在样品中没有表达,干旱胁迫诱导表达的WRKY基因家族成员表达量上调的有49个,而表达量下调的WRKY家族成员有11个。以上结果表明,板栗WRKY基因在对干旱胁迫的响应中发挥了重要作用。
【关键词】板栗 基因家族 WRKY 干旱胁迫
【基金】河北省农林科学院创新工程项目资助(2-06-02);河北省农林科学院科技创新人才建设项目;; 河北省高层次人才资助项目(B2019003037)
【所属期刊栏目】华北农学报
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