运用DNA条形码技术对蛇类进行鉴别
2023-12-14分类号:Q959
【部门】龙岩学院生命科学学院 福建省预防兽医学与兽医生物技术重点实验室 福建省南平市延平区农业农村局
【摘要】为了探讨DNA条形码技术在蛇类物种鉴定的可行性,收集GenBank数据库中蛇类7329 条细胞色素b基因(Cyt b)序列,通过比对修剪,最终获得4665条蛇类Cyt b序列,对种内和种间遗传距离进行计算和遗传进化分析,结果表明:1) 4665条蛇类Cyt b保守位点95个,变异位点616个,简约性信息位点558个,且碱基(A+T)含量高于碱基(G+C)含量;Cyt b序列单倍型数目为1517,单倍型多样性为 0.992 2、核苷酸多样性为0.168 52,平均核苷酸差异36.063。2) 基于Kimura 2–Parameter模型计算出的种内遗传距离平均为3.3%,种间遗传距离平均为19.96%,蛇类种内遗传距离远小于种间遗传距离。3) 蛇类物种种内存在亚种和复合体,其遗传距离在6.3%以上,大于种内平均遗传距离。4)互为姐妹群蛇类物种的种间遗传距离较近,如,Atractus dunni、A. iridescen和 A. occidentali种间遗传距离为0~6.8%,低于种间平均遗传距离。综上,DNA条形码技术可以用于蛇类的物种鉴定,并能识别出蛇类中的亚种、复合体以及姐妹物种。
【关键词】蛇 细胞色素b基因 DNA条形码技术 遗传距离 物种鉴别
【基金】福建龙岩学院博士启动项目(LB2022009)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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