湖南一株猪非典型瘟病毒的鉴定及其E2、NS5B基因序列分析
2024-03-28分类号:S852.651
【部门】湖南农业大学动物医学院
【摘要】随机挑选湖南某规模化猪场出现“抖抖病”的新生仔猪,采集血清样本,用可扩增猪非典型瘟病毒(APPV)NS5B基因和E2基因引物进行RT–PCR鉴定,对PCR扩增产物测序,结果发病仔猪被鉴定为APPV感染阳性。随后利用MegAlign软件分析NS5B基因序列的同源性和E2蛋白结构,并使用 MEGA 5.0 采用邻接法构建其遗传进化树。NS5B基因序列分析表明,鉴定毒株HN0626与GenBank中84株参考毒株的同源性为81.68% ~98.95%;分析预测E2蛋白结构,推导其潜在的B细胞抗原表位。系统发育分析显示,HN0626毒株属于基因1型,是全球猪群中的主要流行毒株,其E2、NS5B基因序列上传至GenBank,登录号分别为OR936135、OR936136。
【关键词】猪非典型瘟病毒 NS5B基因 E2基因 抗原表位预测 遗传进化分析 湖南
【基金】湖南省重点领域研发计划项目(2022NK2049)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
文献传递