3种不同海拔裂腹鱼肾脏转录组比较研究
2024-03-20分类号:S917.4
【部门】上海海洋大学海洋科学学院 大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室 国家海洋生物科学国际联合研究中心 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
【摘要】裂腹鱼亚科鱼类长期生活在青藏高原缺氧环境,是研究低氧适应机制的天然生物模型。对3种裂腹鱼:高海拔(>3 600 m)的孤唇裂腹鱼(Schizothorax curvilabiatus)和巨须裂腹鱼(Schizothorax macropogon)与低海拔(<700 m)齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)的主要渗透调节器官肾脏进行转录组分析。通过对孤唇裂腹鱼和巨须裂腹鱼与齐口裂腹鱼的肾脏转录组进行比较分析,分别筛选出504个和478个差异表达基因,其中有199个共同差异表达基因。对共同差异基因进行GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)的富集分析发现,两组共同差异基因主要富集在糖酵解/糖原生成过程、脂质生物合成过程和血管生成等通路上。其中eno3、fbp1α、prpf19和ctsz等基因的高表达可能在高海拔裂腹鱼长期适应低氧环境中起着重要作用。本研究为揭示高原鱼类长期低氧适应提供了新思路。
【关键词】高原 裂腹鱼 转录组 糖代谢 低氧
【基金】国家重点研发计划项目(2022YFD2400800,2018YFC0310600);; 国家自然科学基金面上项目(31772826)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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