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水稻DBB基因家族的生物信息学分析

2023-09-22分类号:S511

【作者】郝爱平   韩雪杨   薛巨坤   魏继承   任如意
【部门】牡丹江师范学院生命科学与技术学院  
【摘要】【目的】系统地鉴定和分析水稻DBB基因家族,为水稻DBB基因家族的功能研究奠定基础。【方法】基于水稻的全基因组数据,利用生物信息学方法综合分析水稻DBB基因家族的染色体位置、蛋白质的理化性质、进化关系、保守基序、顺式调控元件和表达模式。【结果】从水稻中共鉴定出13个DBB基因,命名为OsDBB1~OsDBB13,这些OsDBB基因在12条水稻染色体中的7条上分布不均。系统发育分析发现,水稻DBB基因家族可分为4个亚族:Group 1~ Group 4,并且同一亚族中DBB基因的内含子和外显子具有相似的数量和排列。水稻的13个OsDBB基因包含10个保守基序,其中Motif 1是这些基因共有的保守基序,推测其与保守结构域相关。OsDBB基因的启动子序列含有与生长发育、激素、应激反应以及光响应有关的调控元件。不同的OsDBB基因在不同组织中表达各不相同,具有一定的特异性。【结论】水稻OsDBB基因在植物生长发育和响应非生物胁迫具有重要作用。
【关键词】水稻  DBB基因家族  生物信息学分析  组织表达  非生物胁迫
【基金】黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(1451ZD004)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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