【摘要】【目的】解析不同咖啡废弃物覆盖下微生物群落结构与功能差异及其关键驱动因子，揭示咖啡废弃物调控土壤微生物群落演替机制，为热区咖啡种植园土壤健康保育技术开发提供理论依据。【方法】本研究开展于海南省万宁市兴隆热带植物园咖啡种质资源圃，分别设置未覆盖咖啡废弃物（C）、覆盖咖啡枯落物（L）、覆盖咖啡果皮（P）和同时覆盖咖啡枯落物和果皮（PL）4种覆盖处理；监测咖啡园生态系统微环境、土壤理化性质、土壤微生物群落丰度与多样性等指标，预测土壤微生物主要功能，同时分析土壤环境因子与土壤微生物群落结构之间的内在关系，探究咖啡废弃物覆盖驱动土壤细菌和真菌群落演替的关键因子。【结果】咖啡果皮覆盖显著提高土壤速效钾和碱解氮含量，提升效果分别达11.95%和16.19%，但对其他土壤理化性状指标影响不显著；一方面，咖啡果皮覆盖显著提高土壤细菌丰富度7.75%以及多样性指数2.79%；此外，咖啡果皮覆盖显著提高变形杆菌门和厚壁菌门细菌的相对丰度，提升效果分别达18.79%和82.52%；但显著降低蓝细菌门相对丰度70.17%。与之相比，咖啡枯落物覆盖显著提高厚壁菌门相对丰度59.05%，但显著降低蓝细菌门相对丰度73.32%。另一方面，咖啡枯落物覆盖显著提高子囊菌门真菌的相对丰度14.80%，但显著降低放线菌门真菌的相对丰度48.38%。尽管咖啡果皮或枯落物覆盖改变部分功能微生物的相对丰度，但土壤微生物主要功能未发生较大改变。【结论】咖啡果皮覆盖显著提高土壤速效钾和碱解氮含量，并促进细菌群落多样性和丰富度提升以及推动细菌群落结构的改变。咖啡果皮覆盖栽培有助于维持咖啡园土壤微生物群落结构与功能的相对稳定，进而促进咖啡园土壤健康保育以及咖啡种植产业的可持续发展。