【摘要】【目的】明确不同连作年限烤烟根系内次生代谢产物种类及其对烤烟品质的影响，为防控烤烟连作障碍提供理论支撑。【方法】以红河泸西县‘云烟87’为供试烤烟品种，选择4个连作年限地块：连作2年、连作3年、连作4年和连作5年，在烤烟成熟期，利用GC－MS检测不同处理烤烟根系内的次生代谢产物含量，通过自相关分析、因子分析和典型相关分析，探析对烤烟品质影响较大的因子类型及其与品质因子（烤烟外观质量、物理特性、常规化学成分、感官质量）相互关系。【结果】连作条件下，烤烟根系内次生代谢产物共检测出14种。因子分析提取了4个主成分因子，分别命名为酚酸类因子、醛酯类因子、酸酯类因子以及酚类因子，累计贡献率达到85.74%。4个主成分因子与烤烟品质典型相关分析发现，烤烟根系内邻苯二甲酸二辛酯、香草醛、十七酸、2，2’-亚甲基双-（4-甲基-6-叔丁基苯酚）和棕榈酸甲酯含量越高，有利于改善烤烟化学成分的协调性，但不利于烤烟其他品质因子的提升；而根系内莨菪亭、软脂酸、花生酸含量越高，2，2’-亚甲基双-（4-甲基-6-叔丁基苯酚）和肉豆蔻酸的含量越低，促进了烤烟感官质量的提高，但对烤烟其他品质因子的改善具有负效应。【结论】烤烟根系内次生代谢产物对烤烟品质因子均有影响，其中的9种影响较大。为了克服连作障碍，应开展相关调控技术研究，调控以上根系内9种关键次生代谢产物的含量，使其维持较低水平，提高烤烟综合品质。