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C型产气荚膜梭菌性腹泻仔猪脾脏转录组分析

2023-10-28分类号:S858.28

【作者】闫尊强   王鹏飞   杨巧丽   黄晓宇   高小莉   滚双宝
【部门】甘肃农业大学动物科学技术学院  甘肃省现代养猪技术工程研究中心  
【摘要】旨在获得C型产气荚膜梭菌性腹泻仔猪血清炎症因子含量、脾脏病理变化及转录组表达谱特征,为其防治提供参考。选择健康状况良好、体质量相近的7日龄二元仔猪6头,随机分为2组,即对照组(CS)和处理组(TS)。TS组每头仔猪每天灌服1 mL菌液(1×10~9 cfu/mL),连续5 d, CS组仔猪灌服不含菌液的培养液,感染后0,1,3,5 d采集血液分离血清,用ELISA方法检测IL-8、IFN-α和IFN-γ含量。试验结束后屠宰仔猪采集脾脏,进行HE染色和RNA-Seq测序,对测序获得的差异表达基因进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,并采用RT-qPCR检测仔猪感染C型产气荚膜梭菌过程中关键差异表达基因的表达量。结果表明:TS组仔猪脾脏出现明显炎症,中性粒细胞浸润,伴有变性及坏死的实质细胞;第3,5天CS组血清中IL-8、IFN-α和IFN-γ含量极显著低于(P<0.01)TS组;TS组与CS组间有1 079个差异表达基因,上调583个,下调496个;差异表达基因富集的GO功能主要有细胞对β干扰素的反应、细胞对DNA损伤刺激的反应、炎症反应的负调控等,富集的KEGG信号通路主要有肺结核、乙型肝炎、B细胞受体等;抵抗C型产气荚膜梭菌感染的候选基因(如JAK3、TLR3、ILF2、CXXC1等)RNA-Seq结果与RT-qPCR结果一致。以上结果表明,JAK3、TLR3等基因通过关键信号通路可能在仔猪脾脏抵抗C型产气荚膜梭菌感染过程中发挥了重要功能。
【关键词】仔猪  腹泻  脾脏  C型产气荚膜梭菌  转录组
【基金】甘肃农业大学畜牧学养猪产业技术创新团队项目(GAU-XKTD-2022-25);; 甘肃省教育科技创新项目(GSSYLXM-02);; 鲁甘科技协作项目(YDZX2021113);; 2022年现代丝路寒旱农业科技支撑项目(GSLK-2022-10);; 甘肃农业大学人才专项(GAU-KYQD-2019-07)
【所属期刊栏目】华北农学报
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