美仁牦牛PDK4基因克隆及组织表达
2023-10-28分类号:S823.85
【部门】中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室 合作市佐盖多玛乡畜牧站 合作市农畜产品质量安全检测检验中心
【摘要】为研究美仁牦牛PDK4基因在各组织中的表达特征,探索其与脂肪沉积机制的相关性,采集了美仁牦牛背最长肌、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪和睾丸等组织样,并提取了其总RNA,通过RT-PCR、生物信息学软件及qPCR等技术对美仁牦牛PDK4基因进行了扩增、生信分析和表达特征研究。结果表明,美仁牦牛PDK4基因CDS区全长1 224 bp,编码407个氨基酸,蛋白相对分子质量为46.159 14 ku,理论等电点6.60,总平均亲水性-0.169,为亲水性蛋白;系统进化树结果表明,美仁牦牛与野牦牛亲缘关系最近,与鬣狗亲缘关系最远;PDK4蛋白有34处磷酸化位点,无信号肽和跨膜区,主要在线粒体中发挥生物学功能;美仁牦牛PDK4蛋白主要是由α-螺旋和无规则卷曲组成。PDK4基因在7日龄美仁牦牛肝脏和肺脏中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),在肌肉、脂肪、脾脏和睾丸中中度表达,在肾和心脏中低表达。随着牦牛年龄增长,PDK4基因在30月龄美仁牦牛脂肪组织中的表达量增加,并显著高于7日龄美仁牦牛脂肪中的表达量(P<0.05)。以上结果表明,PDK4基因可能在美仁牦牛的生长过程中参与脂肪调控,在脂肪沉积过程中发挥重要作用。
【关键词】美仁牦牛 PDK4基因 克隆 实时荧光定量PCR
【基金】国家重点研发计划(2021YFD1600200);; 现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37);; 甘肃省基础研究创新群体项目(20JR5RA580);; 中国农业科学院创新工程(25-LIHPS-01);; 甘肃省科技重大专项(21ZD10NA001;GZGG-2021-1)
【所属期刊栏目】华北农学报
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