美洲鳗鲡腺瘤病毒(AEAdoV)普通PCR和SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用
2023-12-06分类号:S941.41
【部门】福建省农业科学院生物技术研究所
【摘要】为了建立美洲鳗鲡腺瘤病毒(AEAdoV)的检测方法,根据AEAdoV福建株(AEAdoV-FJ)的superfamily 3 helicases (S3H)序列,设计引物,建立了AEAdoV的普通PCR和qPCR检测方法;进一步评价检测方法的灵敏性、特异性及重复性,利用两种方法对美洲鳗鲡“出血性烂鳃”病料进行了检测,并对美洲鳗鲡体内不同组织的病毒含量进行了分析。结果显示,普通PCR扩增的目的片段长度约300 bp,利用其构建了qPCR质粒标准品,其拷贝数与qPCR的阈值循环数(C_(T))线性关系良好,线性范围广,标准曲线相关系数(R~(2))达到0.999,扩增效率为105.067%;建立的普通PCR法和qPCR的最低检测AEAdoV拷贝数分别为100个和10个。上述两种方法均可特异性检测AEAdoV,而对蛙虹彩病毒(RGV)、鳗鲡疱疹病毒(AngHV)、鲤疱疹病毒(KHV)、对虾白斑综合症病毒(WSSV)、日本鳗鲡内皮细胞坏死病毒(JEAdoV)和花鳗鲡腺瘤病毒(MEAdoV)均无扩增反应;qPCR法的组内和组间变异系数均小于2%,表明其重复性良好。临床应用结果显示,35份美洲鳗鲡“出血性烂鳃”病料,采用普通PCR法的AEAdoV检出率为82.8%,而qPCR法的AEAdoV检出率为97%。对美洲鳗鲡不同组织的病毒含量分析结果显示,心脏、肝脏、鳃、鳍的AEAdoV相对含量较高,而黏液、皮肤和脾的病毒含量相对较低。研究表明,建立了AEAdoV的灵敏度高、特异性强的普通PCR和qPCR检测方法,证实AEAdoV与美洲鳗鲡“出血性烂鳃”病密切相关,且在感染鳗鲡主要组织中都存在。上述结果对于研究AEAdoV的致病性,开展其流行情况和病原学情况分析具有重要意义。
【关键词】美洲鳗鲡腺瘤病毒(AEAdoV) 普通PCR 荧光定量PCR SYBR Green I 检测方法 应用
【基金】福建省公益类科研院所基本科研专项(2021R1027007);; 福建省农业科学院“5511”协同创新工程建设项目(XTCXGC2021013)
【所属期刊栏目】水产学报
文献传递