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玉米B3基因家族全基因组鉴定及表达模式

2023-10-15分类号:S513

【作者】仝帧翰   张严玲   王雷立   李安然   王闻琦   王盼盼   刘洪畅   刘青青   王翠玲
【部门】河南科技大学农学院  
【摘要】B3基因家族是植物中特有的转录因子家族,在植物生长发育及胁迫响应中有重要作用。为探究B3基因家族在玉米(Zea mays)中的基本信息及生长发育和逆境胁迫中的生物学功能,本研究对玉米全基因组B3家族成员进行鉴定并分析相关信息,依据转录组数据分析B3基因家族组织特异性表达及胁迫处理下的表达响应。结果显示,玉米B3基因家族包含88个成员,分为ABI、ARF、HSI、RAV和REM 5个亚家族,均含有B3结构域,同一个亚族成员的基因结构及保守基序(数量、类型)相似。分析发现,B3成员基因的启动子区域中均富含激素及逆境响应等功能元件。组织特异性表达分析结果显示,大部分B3基因在分生组织中优势表达。对B3家族成员在冷、热、盐、紫外和干旱这5种胁迫因子的响应表达分析显示,5个亚家族成员均可不同程度参与响应冷、热、盐、紫外和干旱胁迫因子,其中HSI亚家族中的所有成员均参与了对紫外胁迫因子的响应途径。以上结果阐明了B3基因家族在玉米全基因组中的分布、结构和系统发育特征,并依据玉米转录组数据,初步推测其在生长发育和胁迫应激响应中发挥重要作用,为深入研究B3基因家族在玉米中的功能与分子机制提供了数据基础。
【关键词】玉米  B3家族  生物信息学  系统进化分析  生长发育  非生物胁迫  表达分析
【基金】国家自然科学基金河南省联合基金项目(U2004153);国家自然科学基金青年基金项目(31901561);; 河南省重点研发与推广专项(222102110002)
【所属期刊栏目】草业科学
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