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空心莲子草ApCAT基因家族鉴定和表达模式

2023-11-15分类号:S451

【作者】韩晓文   韩硕   胡义锋   王梦如   陈中义   朱永兴   尹军良
【部门】长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心/长江大学农学院/长江大学园艺园林学院  中南民族大学生命科学学院  
【摘要】过氧化氢酶(CAT)是可清除生物体内多余的过氧化氢(H_2O_2)并将其还原成水和氧气的氧化还原酶,在植物响应胁迫的过程中发挥多种功能,保护植物细胞免受活性氧毒害。目前,尚缺乏对空心莲子草(Alternanthera philoxeroides) CAT基因家族成员的系统研究。本研究通过生物信息学分析,从空心莲子草中鉴定到20个ApCAT基因,根据系统发育关系将其依次命名为ApCAT1至ApCAT20。特征分析表明,所有ApCATs均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测发现,所有ApCATs均预测定位于过氧化物酶体,个别ApCATs也预测有定位线粒体、叶绿体和细胞核的可能。表达模式分析表明,ApCAT成员受纬度、海拔、温度、光照、水分条件等的影响较小,表达水平相对稳定。除草剂药效测试发现,20%氯氟吡氧乙酸和13%噁草酮的防治效果最好;结合定量PCR分析发现,ApCAT家族成员在空心莲子草响应除草剂处理过程中显著差异表达,参与对除草剂胁迫的应答过程。本研究系统分析了ApCATs家族成员的基本特征和表达模式,揭示了其除草剂诱导表达特征,为进一步研究ApCATs在空心莲子草响应除草剂胁迫中的生物学功能奠定了基础。
【关键词】过氧化氢酶  生物信息学  转录组  表达特征分析  除草剂  活性氧
【基金】长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心开放基金项目(KFT202305、KF201909)
【所属期刊栏目】草业科学
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