直穗小檗叶绿体基因组特征及系统发育分析
2023-09-04分类号:S567.19
【部门】青海大学生态环境工程学院 青海大学医学院 青海大学藏医学院
【摘要】以直穗小檗为材料进行叶绿体基因组测序和组装,分析其叶绿体基因组结构特征,并讨论系统进化关系。结果表明:直穗小檗叶绿体基因组全长167 036 b,GC含量占总碱基数量的38.16%,共编码144个功能基因;直穗小檗叶绿体基因组序列中共发现109个微卫星位点,A/T碱基组成的单核苷酸重复序列占比最高(73.4%);系统发育分析表明,直穗小檗与朝鲜小檗、黄芦木以及威宁小檗的亲缘关系更近,同时与十大功劳属的阿里山十大功劳和阔叶十大功劳聚为一支。该结果为进一步研究直穗小檗的遗传资源、物种资源鉴定和系统发育分析提供了依据。
【关键词】直穗小檗 叶绿体基因组 重复序列 密码子偏好性 系统发育
【基金】青海省科技厅基础研究项目(2022-ZJ-714)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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