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合作猪StAR基因克隆、组织表达及生物信息学分析

2023-08-28分类号:S828

【作者】闫尊强   计亚楠   王鹏飞   张博   石海霞   滚双宝
【部门】甘肃农业大学动物科学技术学院  甘肃省现代养猪工程技术研究中心  
【摘要】旨在对合作猪StAR基因CDS区进行克隆及生物信息学分析,采用RT-qPCR方法检测StAR基因在不同组织中的表达量,以揭示其功能。结果发现,合作猪StAR基因CDS区长858 bp,编码285个氨基酸,与猪参考序列相比,第572位点处的A突变为G,导致第191位的赖氨酸突变成精氨酸,为错义突变,第791位点处插入1个碱基C,后续的20个氨基酸发生改变,导致移码突变;蛋白分子量90.95 ku,理论等电点8.87;消光系数33 835,不稳定系数41.49;含1个N-糖基化位点,二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲构成,二级结构与三级结构基本一致;合作猪与猪、绵羊和黄牛StAR基因核苷酸序列相似性分别为99.77%,90.45%,91.78%;进化树结果显示,合作猪与猪亲缘关系最近,表明StAR基因编码序列具有种属特异性;StAR蛋白是不稳定的亲水性蛋白,无信号肽和跨膜区;StAR基因在脾、肾、肺等组织中均有表达,睾丸表达量较高,表明可能与合作猪睾丸发育有关。
【关键词】合作猪  StAR基因  生物信息学  组织表达
【基金】甘肃省教育科技创新项目(GSSYLXM-02);; 鲁甘科技协作项目(YDZX2021113);; 2022年现代丝路寒旱农业科技支撑项目(GSLK-2022-10)
【所属期刊栏目】华北农学报
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