【摘要】【目的】探究捕食线虫性真菌Duddingtonia flagrans几丁质酶的生物学特性与亲缘关系。【方法】对捕食线虫性真菌D. flagrans几丁质酶CTS3和CTS4基因进行克隆和测序，并对其编码蛋白的信号肽、亲/疏水性、催化结构域、保守序列、二级与三级结构等分子特征进行预测以及其他真菌几丁质酶的亲缘关系进行分析。【结果】几丁质酶CTS3和CTS4含有几丁质酶催化结构域的2个高度保守序列（SIGG和DGFDLDXE）及一个典型的(α/β)_(8)桶状结构域，属于糖苷水解酶18家族（GH18）。CTS3和CTS4几丁质酶均为分泌型蛋白，在N端的第1～25和1～18个氨基酸分别为其信号肽序列，C端均含有糖苷水解酶18家族结构域。分子结构分析表明，几丁质酶CTS3和CTS4三级结构具有(α/β)_(8)的TIM桶形结构， 中心部分为平行的β-折叠组成的内桶，外桶由α_(1)～α_(8)组成；底物结合区域位于保守序列β_(3)和β_(4)链形成的环状裂隙。亲缘关系分析表明，CTS3 和CTS4与昆虫致病真菌几丁质酶同源性较高，它们聚为一支，推测在侵染宿主的过程中具有相似的生物学功能。【结论】2个几丁质酶基因分子特征与亲缘关系的阐明，为研发新型家畜消化道线虫病生防制剂奠定了基础。