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利用SRAP分子标记分析谷瘟病菌遗传多样性

2023-10-28分类号:S435.15

【作者】刘佳   张梦雅   任世龙   王永芳   马继芳   全建章   刘磊   董志平   白辉   李志勇
【部门】河北省农林科学院谷子研究所河北省杂粮重点实验室农业农村部特色杂粮遗传改良与利用重点实验室(部省共建)  
【摘要】了解谷瘟病菌的变异和群体结构,为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增,利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析,通过UPGMA方法进行聚类分析,使用Popgene 32软件计算各群体间的遗传多样性指数。结果表明,筛选出了8对引物用于谷瘟病菌的遗传多态性分析,这8对引物共扩增出条带1 728条,其中多态性条带1 492条,多态性比率为86.34%。对90株病原菌进行聚类分析,其相似性系数为0.77~0.85,遗传相似系数为0.802时,所有菌株被分为27个遗传宗谱(L1~L27),其中L1为绝对优势组群,共包含来自山东、河北、山西、河南和辽宁5个省份的29株谷瘟病菌,占总菌株的32.22%。经Popgene 32软件计算分析,9个地区谷瘟病菌的Nei′s遗传多样性指数(H)为0.141 4~0.288 1,Shannon′s信息指数(I)为0.196 0~0.441 6,河北夏谷区Nei′s遗传多样性指数和Shannon′s信息指数最高,遗传多样性最丰富,而海南群体遗传多样性最低。对不同地区谷瘟病菌群体比较,吉林群体与海南群体的遗传亲缘关系最远,而河北夏谷区群体与河北春谷区群体的亲缘关系最近。可见,不同地区谷瘟病菌的遗传多样性丰富,各菌株间存在遗传分化,但菌株间的遗传分化与地理来源无明显相关性。
【关键词】谷子  谷瘟病菌  SRAP  相似性系数  遗传多样性
【基金】河北省自然科学基金(C2021301062);; 河北省农林科学院基本业务费(2021030201);; 河北省重点研发计划项目(21326338D);; 河北省农林科学院基本科研业务费包干制项目(HBNKY-BGZ-02);; 国家谷子高粱产业技术体系(CARS-06-14.5-A25)
【所属期刊栏目】华北农学报
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