标题
  • 标题
  • 作者
  • 关键词

大豆胞囊线虫响应GRAS基因家族鉴定及生物信息学分析

2023-10-28分类号:S435.651

【作者】刘芳   曲硕   孙浩文   姜海鹏   韩英鹏
【部门】东北农业大学大豆研究所  
【摘要】为了研究GRAS转录因子在大豆胞囊线虫(SCN)胁迫应答中起到重要的作用,将抗病品种东农L-10和感病品种黑农37分别接种SCN 3号生理小种。品红染色确定接虫成功后,提取植株根部进行转录组测序分析。整理共得到20个与SCN相关的候选基因。对编码蛋白的二、三级结构、磷酸化位点、亲水性和疏水性、启动子信息、基因进化关系等进行生物信息学分析研究。取植株的不同组织部位,根、茎、叶提取mRNA并反转录cDNA,对重点的候选基因进行RT-PCR。结果显示:该家族基因与MYB和MYC转录因子存在密切的关系。基因编码蛋白主要以α-螺旋、无规则卷曲为主,二级结构和三级结构高度一致;蛋白为可溶性蛋白,磷酸化位点以丝氨酸为主,RT-PCR表明在植物的不同组织部位均存在一定的表达量,主要以根部为主,在相同的大豆胞囊线虫胁迫下,抗病品种中GRAS表达量显著高于感病品种。上述结果表明,GRAS转录因子为SCN相关的抗性基因,为抗病胁迫响应应答反应提供了重要的基因来源。
【关键词】大豆  GRAS转录因子  RT-PCR  生物信息学  大豆胞囊线虫
【基金】国家自然科学基金面上项目(31971967);; 黑龙江省重点基金项目(ZD2022C002);; 黑龙江省重点研发项目(JD22A015)
【所属期刊栏目】华北农学报
文献传递