【摘要】【目的】在了解表型与基因型差异的基础上同时对候选常规粳稻亲本进行分类，随后结合育种亲本选配四大原则进行优异亲本选配，为常规粳稻育种提供一种亲本组合选配方法。【方法】以江苏省自主选育水稻品种为材料，考察34个品种的42个表型性状，并利用41对SSR标记对以上34个品种进行基因型鉴定。通过表型值与基因型值分别计算欧几里得距离、遗传相似系数，采用Ward.D法、UPGMA法进行聚类分析。【结果】农艺性状、品质性状的遗传相似性分析表明大部分试验品种的遗传基础背景比较相近，但SSR标记的遗传相似性分析显示34个品种的遗传相似系数在0.39～0.95，表明江苏不同单位育成的品种遗传背景仍存在不同。聚类分析结果表明，不同类群间农艺性状、品质、等位基因差异与不同生态型不存在明显关系。AMOVA分析显示试验品种96.19%的遗传变异来源于群体内。【结论】不同聚类结果得到的类群不完全一致，将农艺性状、品质性状、SSR标记的聚类结果结合起来对亲本进行分类更有利于增加亲本选配的精确度、减少育种工作量、增加育种效率。本研究应用多种指标聚类方法进行常规粳稻亲本选配，在镇稻18号与盐稻11号组合中，选育出大量优异中间材料，并育成了不同生态型新品种镇稻23号、镇稻32号和镇稻33号。