【摘要】【目的】为揭示柿子树与苹果树间作体系下，苹果根际微生物群落结构和土壤理化性质，【方法】本研究以间作（I）和非间作（NI）的苹果根际土壤为材料，采用高通量测序技术，对苹果根际微生物群落结构进行了分析。【结果】间作柿子树增加了苹果根际土壤有机质（OM）、水解性氮（AN）、全磷（TP）含量，降低了土壤中有效钾（AK）含量。Alpha多样性分析表明，间作对苹果根际土壤细菌丰富度指数和多样性指数无显著影响，但显著降低了根际土壤真菌的Ace指数（P=0.03）。β多样性分析表明，间作和非间作土壤细菌和真菌群落结构都存在显著差异。进一步LEfSe分析发现，间作显著增加了苹果根际土壤中17个细菌属的丰度，分别为Sporacetigenium、Tepidisphaera 、Agromyces、Alkanindiges、Phycisphaera、假黄色单胞菌属（Pseudoxanthomonas）、Terrimonas、Pseudohaliea、Paenisporosarcina 9个已知属，8个未知属；显著降低了4个细菌属的丰度，分别为Sporichthya、Methylocystis、Devosia 、Altererythrobacter。间作显著增加了1个真菌属的丰度，为Arthrographis；降低了3个真菌属的丰度，分别为柱孢属（Cylindrocarpon）、Metacordyceps、 外瓶霉属（Exophiala）。Spearman相关性分析表明，根际细菌属Pseudomonas与有效磷（AP）、全磷（TP）呈显著正相关性，真菌属Naganishia与有效磷（AP）呈显著正相关性；真菌属Polyscytalum、Minimedusa与有效磷（AP）呈显著负相关性。PICRUSt2结果显示，间作显著降低了根际细菌碳水化合物运输和代谢以及胞外结构两大类功能丰度；FUNGuild功能分析显示，间作显著降低了病原-腐生过渡型真菌在苹果根际土壤的丰度。【结论】苹果与柿子树间作可提高苹果根际土壤OM、AN、TP含量，显著增加根际有益微生物的相对丰度，减少病原真菌微生物的相对丰度，为探讨间作抗病机理提供数据参考。