热应激对奶牛GNAS启动子区DNA甲基化水平的影响
2023-06-16分类号:S823
【部门】北京交通大学生命科学与生物工程研究院 中国农业大学动物科技学院 北京农学院 北京首农畜牧发展有限公司 北京生物种业创新联合体
【摘要】【目的】热应激严重影响奶牛的生产和健康,是制约奶业持续健康发展的重要因素。DNA甲基化作为一种重要的表观遗传调控机制参与动物的热应激反应,但其在奶牛热应激过程中的作用和分子机制研究较少。研究通过检测奶牛热应激相关的DNA甲基化变化,筛选和验证DNA甲基化相关的关键基因,为奶牛热应激的表观遗传机制研究积累数据。【方法】以北京市三元绿荷金银岛牧场的24头中国荷斯坦牛(泌乳阶段及胎次相同)为研究对象,分别于春季(非应激期,2017年4月份)和夏季(热应激期,2017年7月份)采集试验个体的血液,提取DNA,共获得48份DNA样本。首先,随机选择其中15头奶牛,并随机分为3组,每组5份DNA样本混合,通过全基因组重亚硫酸盐测序法(Whole-genome bisulfite sequencing, WGBS)检测奶牛基因组DNA的甲基化状态,筛选差异甲基化区域(Differential methylation region, DMR; 1000 bp windows, 500 bp overlap, P<0.01),GNAS启动子的CG位点整体甲基化水平显著上调(P<0.05),21号和27号CG均为显著上调的差异甲基化位点,与个体水平结果一致。【结论】热应激会引起奶牛GNAS启动子甲基化水平增加,GNAS是奶牛热应激DNA甲基化调控的潜在靶基因。
【关键词】热应激 奶牛 WGBS DNA甲基化 GNAS基因
【基金】国家自然科学基金外国青年学者研究基金(3175011045);; 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-36)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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