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基于转录组测序筛选乌苏里白鲑肌肉生长关键候选基因研究

2023-06-14分类号:S917.4

【作者】李文文  徐革锋  黄天晴  谷伟  刘恩慧  王高超  潘玉财  周金鑫  姜再胜  王炳谦  
【部门】上海海洋大学水产与生命学院  冷水性鱼类产业技术创新战略联盟中国水产科学研究院黑龙江水产研究所  安徽省桐城市水产服务中心  
【摘要】为了挖掘调控乌苏里白鲑(Coregonus ussurinsis Berg)肌肉生长的关键候选基因,本研究对不同生长速度乌苏里白鲑的肌肉组织进行转录组测序,以期为乌苏里白鲑群体选育提供基础数据。首先,在同等条件下(从混合池中)随机选择乌苏里白鲑F_(2)个体进行实验分组(快长组和慢长组)。接着分别从快长组(219.20±38.66) g和慢长组(74.30±17.86) g中随机选取10尾样本,取其背部肌肉进行转录组测序。以FDR1为条件筛选差异表达基因并对其进行GO (gene ontology)和KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析,并通过qPCR验证转录组数据的准确性。转录组测序结果显示,共筛选出2 211个差异表达基因,与慢长组相比,快长组中583个差异基因表达上调及1 628个基因表达下调。GO功能注释结果显示,差异基因主要参与细胞过程和结合过程,差异基因显著富集到251条KEGG通路(P
【关键词】乌苏里白鲑  转录组  差异表达基因  肌肉生长
【基金】中国水产科学研究院科研业务费项目(2020TD32);; 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-46);; 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(HSY202103M)共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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