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桂花OfACOs基因家族鉴定及表达分析

2023-04-23分类号:S685.13

【作者】张耀  王家璇  蔡璇  曾祥玲  杨洁  陈洪国  邹晶晶  
【部门】湖北科技学院国家林业草原桂花工程技术研究中心  咸宁市高新桂花产业技术研究院  
【摘要】【目的】对桂花Osmanthus fragrans乙烯合成路径氨基环丙烷羧酸氧化酶(1-aminocyclopropane-1-carbox-ylate oxidase, ACO)基因家族进行了全基因组鉴定及表达分析,以探索参与桂花花瓣乙烯合成的关键ACO家族成员。【方法】以桂花品种‘柳叶金桂’O. fragrans‘Liuye Jingui’为参考基因组,对桂花OfACOs家族进行鉴定、进化分析、基因结构分析以及根、茎、叶、芽和不同开花阶段的表达模式分析。【结果】通过蛋白保守结构域(protein families,pfam)分析,从桂花基因组中共鉴定出了122个OfACOs成员,分布于22条染色体上;保守基序分析表明:大多数OfACOs基因同时包含Motif 1、 Motif 2、Motif 3、Motif 4和Motif 7这5个保守基序,它们共同组成OfACOs保守结构域;共线性分析结果表明:与拟南芥Arabidopsis thaliana基因为共线性对的基因可能具有相似的功能。结合swiss-prot同源序列对比分析,筛选出27个成员作为候选研究对象,进行不同组织部位根、茎、叶、芽和不同开花阶段的转录组测序分析,结果发现:12个成员在花瓣中显著表达,其中LYG006223、LYG007706、LYG007045、LYG035696等4个成员在开花后期极显著差异上调表达。进一步对该4个成员进行荧光定量PCR验证分析,结果与转录组测序结果一致。【结论】通过OfACOs基因家族的全基因组鉴定及基因克隆分析,筛选到在开花后期显著差异上调的4个ACO家族成员可能参与桂花花瓣衰老的调控。图6参34
【关键词】桂花  OfACOs  乙烯  衰老  基因家族
【基金】国家自然科学基金资助项目(32271951,32101581);; 湖北省科技创新专项(2021BBA098);; 湖北省中央引导地方专项(2022BEG263)
【所属期刊栏目】浙江农林大学学报
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