核桃炭疽病菌中GH蛋白的互作蛋白找寻及遗传关系分析
2023-06-26分类号:S436.64
【部门】西南林业大学生物多样性保护学院 云南省森林灾害预警与控制重点实验室
【摘要】植物病原真菌中的糖苷水解酶(GH)是参与破坏植物细胞壁的重要酶类,在其致病过程中发挥着重要作用。基于前期所获得的胶孢炭疽菌Cg1中20个GH蛋白,通过STRING网络在线分析与其相似性较高的两个炭疽菌种——胶孢炭疽菌Cg-14和果生炭疽菌Nara gc5相关蛋白的互作关系。结果发现,两个炭疽菌菌株GH蛋白的互作情况极为相似。其中:GH5的互作蛋白数量最多,且GH5、GH6、GH7、GH11之间均存在明显互作关系;GH28亚家族中两个蛋白之间互作但不与其他GH亚家族蛋白互作;与单独GH蛋白存在互作关系的其他类蛋白多参与多糖催化、碳水化合物代谢等过程。此外,利用生物信息学分析工具对上述蛋白进行了分子对接、亚细胞定位及遗传关系分析。结果发现:不同蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸位点;仅归属于GH72亚家族的3个蛋白定位于质膜,其余蛋白均定位于细胞外;胶孢炭疽菌Cg1、Cg-14以及果生炭疽菌Nara gc5中GH蛋白明显分为四大类。其中:GH43亚家族中的3个蛋白分属于不同分支,亲缘关系较远;GH5中的3个蛋白有两个属于同一分支,另一个单独在一个分支;而GH7、GH11、GH28亚家族内部的蛋白均属于同一分支。本研究结果可为深入研究核桃炭疽病菌中GH家族蛋白的协同作用机制提供参考。
【关键词】胶孢炭疽菌 果生炭疽菌 互作蛋白 生物信息学分析 遗传关系
【基金】国家自然科学基金项目(31960314);; 云南省“兴滇英才支持计划”青年人才专项(YNWR-QNBJ-2020-188);; 云南省教育厅科学研究基金项目(2023Y0725);; 云南省研究生导师团队建设项目(2022100)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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