东方蜜蜂微孢子虫RCDP42基因的分子克隆与生物信息学分析
2023-07-06分类号:S895.3
【部门】江西省蜜蜂生物学与饲养重点实验室 福建农林大学动物科学学院(蜂学学院) 广东省农业科学院动物研究所
【摘要】对东方蜜蜂微孢子虫RCDP 42基因进行分子克隆,并通过生物信息学解析RCDP 42蛋白的分子特性,进而对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RCDP 42蛋白进行保守基序和结构域预测及分析。结果表明,成功克隆到东方蜜蜂微孢子虫RCDP 42基因的CDS区,RCDP 42基因在孢子中真实表达,含有540个核苷酸,可编码179个氨基酸;RCDP 42蛋白的分子质量约为20.3 ku,分子式为C_(915)H_(1416)N_(230)O_(274)S_(10),脂溶系数为86.03,等电点为6.57;包含的亲水氨基酸数量多于疏水氨基酸,但不含信号肽与跨膜结构域,说明RCDP 42可能为亲水性蛋白、胞内蛋白和非跨膜蛋白,可能包含16个磷酸化位点、63个α-螺旋、43条延长链、11个β-转角及62个无规则卷曲。在东方蜜蜂微孢子虫、蚱蜢脑炎微孢子虫和肠脑炎微孢子虫的RCDP 42蛋白中均鉴定到3个保守基序(motif 1、motif 2和motif 3)与1个结构域(Rho)。
【关键词】东方蜜蜂微孢子虫 ras相关细胞分裂蛋白42样蛋白 分子克隆 分子特性 系统进化
【基金】国家自然科学基金面上项目(32172792);; 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-44-KXJ7);; 福建省自然科学基金面上项目(2022J01131334);; 福建农林大学硕士生导师团队项目;; 江西省蜜蜂生物学与饲养重点实验室开放基金
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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