【摘要】日本的大学科研实力一直处于世界较为领先地位，从经济需求视角分析日本的大学科研模式与运行机制，更能领悟其独到之处。日本的大学科研具有典型巴斯德象限科研模式特征，以经济需求为纽带，大学基础科研形成了经济需求导向下受经济需求约束、激励和保障的外部运行机制。在经济需求影响下，日本的大学科研在寻求行政和学术平衡的科研自治、设定迎合经济需求的科研经费分配机制、产出和转化满足经济需求的科研成果和科研能力三个层次上，由投入产出要素运行的基本轨迹与组织管理结构发挥的机能共同形成内部运行机制。日本的大学科研模式和运行机制，体现出了科研的主动性与弹性，但也面临现实的挑战。